Аналитическая и трансляционная геномика

Общий ресурс аналитической и трансляционной геномики (ATG) предоставляет секвенирование нового поколения и другие услуги, связанные с геномикой, для членов Онкологического центра ЕНД и других пользователей в ЕНД и дочерних учреждениях. Основные услуги включают в себя секвенирование следующего поколения с использованием двух инструментов Ion Proton S5/XL и связанную с этим экспертную поддержку в области биоинформатики. К ним относятся обычная «объемная» секвенирование РНК, секвенирование РНК отдельных клеток с использованием системы 10x Genomics, целевое секвенирование ДНК, ChIP-seq и множество других анализов, многие из которых можно проводить как с живыми, так и с замороженными клетками или тканями. или заархивированные (например, FFPE) образцы. Приборы Ion Proton S5/XL особенно подходят для анализа РНК низкого качества, например, из материала FFPE, анализ которого с помощью других технологий затруднен или невозможен. Приборы генерируют до 100 миллионов считываний на чип секвенирования, и мы стремимся обеспечить быстрый оборот, если это возможно. В конце 4 года ATG добавит новый секвенатор Singular Genomics G2022, который значительно расширит набор услуг секвенирования нового поколения, доступных внутри компании.

Общий ресурс поддерживается онкологическим центром UNM, включая основной грант CCSG P30CA118100 и другие фонды, а также за счет средств штата NM и сборов с пользователей.

Специалисты доступны для консультаций, чтобы помочь пользователям разработать наилучшие возможные эксперименты, чтобы максимально повысить качество получаемых данных.

Доктор Несс (слева) и сотрудники отдела геномики

Директор факультета

Скотт А. Несс, К.т.н.
Профессор, терапевт/ Молекулярная медицина
Кабинет: CRF 121; Тел .: (505) 272-9883

Технический директор / Биоинформатика

Кэтрин (Чарли) Брейер, доктор философии

Старший технический персонал

Кел Кук CRF 118 Тел .: (505) 272-5564
Дженнифер Вудс CRF 121 Тел .: (505) 272-3464
Мэгги Сайфери CRF 121 Тел .: (505) 272-2464